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单细胞与空间转录组分析研究进展
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作者单位
许醒,蔡林峰,张倩楠,杨启正,梁珊珊,李铭殷,李翀,杨朝勇 1. 厦门大学 化学化工学院福建 厦门 361005 2. 上海交通大学 分子医学研究院上海 200217 
基金项目:国家自然科学基金资助项目(21927806,21735004,21521004,21325522,21904085)
中文摘要:单细胞的异质性在胚胎发育、神经系统发育、癌症病变等生物学过程中具有重要的研究意义。单细胞转录组测序利用测序技术解析细胞内转录本序列,为细胞异质性研究提供可靠、准确的研究手段及观测视野,为揭示生物发育规律、疾病发生发展机制等提供了重要的技术手段。该文围绕单细胞与空间组学分析,综述了近年来发展的各类单细胞转录组测序、单细胞多组学测序及空间转录组分析方法,分析了其优缺点。同时展望了单细胞与空间转录组分析领域的发展趋势,即开发低成本、全方位、高通量、高分辨的单细胞空间多组学分析方法以实现对单个细胞更为细致、全面及准确的描述和精准单细胞图谱构建。
中文关键词:单细胞测序  转录组  多组学  空间转录组  研究进展
 
Progress on Single-cell and Spatial Transcriptome Analysis
Abstract:Heterogeneity in single cells has important implications for embryo development,neurogenesis and cancer progress.Single-cell transcriptome sequencing,decoding transcript sequences within cells based on high-throughput sequencing technology,can provide reliable and accurate research methods for cellular heterogeneity study to reveal the rule of biological development and disease progress.Different methods for single-cell transcriptome sequencing,single-cell multi-omics sequencing and spatial transcriptome analysis in recent years are summarized in this review.Challenges and perspectives of single-cell and spatial transcriptome analysis are discussed.Low-cost,all-round,high-throughput,high-resolution single-cell spatially multi-omics analysis is helpful to construct comprehensive and accurate single-cell atlas.
Key Words:single-cell sequencing  transcriptome  multi-omics  spatial transcriptome  research progress
引用本文:许醒,蔡林峰,张倩楠,杨启正,梁珊珊,李铭殷,李翀,杨朝勇.单细胞与空间转录组分析研究进展[J].分析测试学报,2022,41(9):1322-1334.
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